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A Amazônia abriga grande parcela da diversidade de anfíbios anuros no mundo, cerca de 309 espécies são encontradas neste bioma, algumas com ampla distribuição, tendo grande probabilidade de apresentar diversidade críptica. Os anuros são um grupo bastante vulnerável às variações do meio ambiente, portanto, os estudos taxonômicos acerca dessa Ordem são prioritários em áreas com grande biodiversidade e limitadas pesquisas como ainda é o caso da Amazônia. Apesar de amplamente distribuída, Physalaemus ephippifer carece de informações acerca de sua diversidade morfológica e molecular, à vista disso, o estudo concentra-se na necessidade de uma investigação taxonômica integrativa a respeito do táxon, com a finalidade de apontar possíveis espécies candidatas e ampliar o conhecimento sobre a diversidade de anuros amazônicos. As amostragens molecular e morfológica incluem a maior distribuição possível da espécie. Foram amplificados dois genes mitocondriais e um nuclear, com as sequências resultantes foi executada uma análise filogenética de Máxima Verossimilhança. Espécimes foram examinados e tiveram medidas tomadas afim de se realizar uma análise discriminante utilizando os dados de adultos e juvenis para descobrir variações entre as populações. A análise filogenética empregada recuperou a espécie como monofilética, revelando quatro clados distintos, estruturados geograficamente. Os dados morfológicos corroboraram as análises moleculares, apontando a possibilidade de novas espécies dentro de P. ephippifer.
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