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Experimentamos uma grande mudança de paradigma no conhecimento da biodiversidade, transcendendo os estudos puramente descritivos em direção a uma perspectiva funcional com diferentes facetas da diversidade de organismos. A inclusão de parasitos em inventários básicos de biodiversidade fornece informações substancialmente maiores do que o estudo de organismos de vida livre sozinhos. A acurada identificação de hospedeiros e parasitos pode resultar em valiosas informações sobre as relações evolutivas, distribuição geográfica e dinâmica da associação. A combinação de avanços técnicos, dados empíricos e técnicas analíticas propicia uma forte abordagem integradora, através da qual o estudo de parasitos de anfíbios e répteis pode contribuir de maneira efetiva tanto para revelar a biodiversidade quanto para evitar sua perda. Essas abordagens revelam informações importantes sobre o habitat do hospedeiro, modo de forrageio, comportamento e fisiologia, biologia reprodutiva, e também fornece boas intuições sobre as interações tróficas e filogeografia. É importante o desenvolvimento de protocolos proativos para monitoramento de alterações nas comunidades parasitárias, doenças e estrutura dos ecossistemas, como meio de detectar potenciais doenças emergentes. A biologia molecular contribuiu para a atual mudança de paradigma, mas também exigiu alguns ajustes em nossas metodologias tradicionais. Aqui, apresentaremos um guia prático para a coleta de dados parasitológicos de anfíbios e répteis. Escrevemos especialmente para aqueles que pretendem incluir dados parasitológicos em sua amostragem, para herpetologistas e naturalistas que já colaboram com parasitologistas, e também para aqueles que aspiram a seguir uma carreira de pesquisa com parasitos de anfíbios e répteis.
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