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Estudos morfológicos são fundamentais para desvendar aspectos da biologia das espécies. Pesquisas sobre osteologia do crânio são importantes para identificação de variações morfológicas e variações intraespecíficas entre espécies. O gênero Hemidactylus, família Gekkonidae, é representado no estado do Ceará por duas espécies, uma nativa, H. agrius, e uma exótica, H. mabouia. As duas espécies carecem de dados mais profundos de sua morfologia, sendo utilizados para a sua identificação, apenas dados da literatura provindos de morfologia externa, gerando muitas vezes conflitos ou erros na identificação dos exemplares. O objetivo desse trabalho foi descrever e comparar a osteologia craniana das espécies H. mabouia e H. agrius de forma a se verificar a existência de novas características que venha a contribuir tanto para uma melhor identificação dos exemplares quanto para melhor conhecer sua biologia. Para esse estudo foram utilizados 6 exemplares de cada espécie tombados da Coleção Herpetológica do IFCE, coletados no Município de Acaraú, estado do Ceará. Os espécimes foram diafanizados e corados com Alizarina e analisados em microscópios estereoscópicos. Com a descrição dos crânios, foi possível observar que a osteologia craniana dessas espécies é bastante semelhante entre si e estão de acordo com as descrições já realizadas para a família Gekkonidae. Contudo, também foi possível identificar alguns padrões de diferenciações morfológicas entre alguns ossos do crânio dessas espécies, que foram referentes ao formado do crânio, da fenestra suborbital, e dos ossos premaxila e pós-frontal. Essas diferenças podem ser utilizadas como uma ferramenta de diferenciação entre as duas espécies.
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