Organismos zoospóricos são comumente encontrados em ecossistemas aquáticos e terrestres, entretanto, pouco se conhece sobre sua distribuição e diversidade nesses ambientes. Este estudo avaliou a distribuição, frequência e diversidade de fungos zoospóricos pertencentes aos filos Oomycota, Blastocladiomycota e Chytridiomycota em três lagoas na cidade de Teresina, Piauí. Foram realizadas oito coletas bimestrais de água e de solo nas lagoas, de março de 2011 a junho de 2012. A técnica utilizada consistiu na iscagem, em laboratório, com substratos celulósicos (palha de milho, sementes de sorgo, epiderme de cebola, papel celofane e papel filtro), quitinosos (asas de cupim) e queratinosos (ecdises de cobra e fios de cabelo humano). As lagoas, os compartimentos de água e solo, e as estações chuvosa e seca, foram tratadas pelos cálculos da riqueza de espécies (S), índice de diversidade de Shannon (H’), equitatividade (E), índice de Simpson (D). Foram identificados trinta e quatro táxons, sete ordens e doze famílias. As famílias foram representadas por Olpidiopsidaceae (1 espécie), Pythiaceae (4 espécies), Pythiogetonaceae (3 espécies), Leptolegniaceae (2 espécies), Saprolegniaceae (10 espécies), Blastocladiaceae (3 espécies), Catenariaceae (1 espécie), Chytridiaceae (1 espécie), Cladochytriaceae (4 espécies), Endochytriaceae (2 espécies), Gonapodyaceae (2 espécies) e Rhizoplhyctidaceae (1 espécie). A família Saprolegniaceae prevaleceu dentro do filo Oomycota, enquanto que para Blastocladiomycota e Chytridiomycota, a predominância deu-se com a família Cladochytriaceae. Relacionando-se às frequências das espécies, as de maiores registros ocorreram com Aphanomyces keratinophilus (87,5%), Dyctyuchus pseudodictyon (62,5%), Pythiogeton ramosum (50%) e Catenochytridium carolineanum (41%). Olpidiopsis achlyae foi exclusiva da lagoa do Mocambinho, ocorrendo na estação chuvosa. Onze táxons foram exclusivos da estação chuvosa (5 Oomycota e 6 Chytridiomycota) e seis da estação seca (3 Oomycota e 3 Chytridiomycota). Aphanomyces keratinophilus, com 27 ocorrências, apareceu em todas as coletas nas três lagoas, apresentando maior ocorrência na estação chuvosa (n=19). Pythiogeton ramosum apresentou maior ocorrência na estação seca (n=11). Os índices biológicos de Sorensen, Shannon, Equitatividade e Simpson, sugeriram que a distribuição e ocorrência dos fungos zoospóricos podem ser independentes dos fatores abióticos.