A etiologia da diarreia neonatal em bovinos é bastante complexa e envolve múltiplos fatores. Entre os fatores determinantes de etiologia viral, o rotavírus (RV) e o coronavírus bovino (BCoV) estão entre os patógenos mais frequentemente detectados em casos de infecções intestinais em bezerros neonatos, podendo atuar de forma isolada ou em associação. A participação do picobirnavírus (PBV) como agente causal das diarreias é ainda controversa. Alguns estudos têm sugerido que o PBV não possui uma relação etiológica com a diarreia, mas sim com diversas condições de imunossupressão que favorecem a replicação e excreção viral. O objetivo deste trabalho foi realizar um estudo retrospectivo para investigar a presença de BCoV e PBV em fezes diarreicas de bezerros provenientes de um rebanho endemicamente infectado pelo RV, localizado no município de Mariluz - Paraná. A propriedade, de aptidão leiteira, possuía histórico recorrente de diarreia neonatal, tendo sido detectado o RV em 52% (33/63) dos animais nascidos no período compreendido entre março de 2013 e fevereiro de 2014. Desta coleção biológica, foram selecionadas 14 amostras negativas para RV para pesquisa de BCoV e PBV. Alíquotas de suspensões fecais a 10% em tampão TRIS-Cálcio foram submetidas à extração do ácido nucléico pela associação das técnicas fenol clorofórmio – álcool isoamílico associada à sílica-isotiocianato de guanidina e em seguida submetidas à técnica de Semi-nested PCR para a amplificação parcial do gene N do BCoV e RT-PCR para a detecção do gene RdRp do PBV. Das 14 amostras analisadas, foi possível a detecção molecular do BCoV em duas amostras e do PBV em uma amostra, sendo esta última um caso de co-infecção PBV/BCoV. Estes resultados demonstram a circulação do BCoV em rebanhos bovinos no Paraná ratificando a multifatoriedade das diarreias neonatais. Além disso, reforça a necessidade de novos estudos envolvendo o PBV, seja como agente etiológico primário das diarreias neonatais ou como um patógeno oportunista em situações de imunossupressão.