Desenvolvimento de um teste molecular rápido baseado em LAMP para discriminação varietal de Coffea canephora

Exploramos a importância estratégica da diferenciação de variedades botânicas de Coffea canephora: Robusta, Conilon e Híbrido, para apoiar a certificação genética, rastreabilidade e programas de melhoramento. A proximidade genética dificulta a determinação de alvos específicos e métodos tradicionais morfológicos e moleculares são demorados e custosos, limitando sua aplicação em larga escala. Para atingir esse propósito e superar esses desafios, desenvolvemos uma pipeline de bioinformática para identificar alvos moleculares de alto contraste e um teste molecular rápido baseado em amplificação isotérmica mediada por loop (LAMP). Foram identificados dois primers promissores na presença/ausência de amplificação: um com amplificação específica para Conilon e outro para Conilon e Híbrido, a ausência de amplificação para os indivíduos da variedade Robusta, combinado com os resultados de amplificação para os dois primers, permite discriminação varietal. O ensaio apresentou alta reprodutibilidade, sensibilidade de detecção de 0,5% de misturas, baixo custo e revelação simples em gel de agarose. Este estudo contribui para a identificação e o desenvolvimento de uma ferramenta rápida, confiável e acessível para discriminação varietal, com aplicações em viveiros, cooperativas e programas de melhoramento, fortalecendo a competitividade e a sustentabilidade da cafeicultura brasileira.