perspectivas futuras
Publicação: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Olá Thais
Bem interessante o trabalho de vocês, parabéns.
Vocês estão planejando também calcular a interação
entre o MDMA e oligômeros ou polímeros do monômero
escolhido?
Abraços
Paulo Netz
Dúvidas
Publicação: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Olá Thais, parabéns pelo trabalho e apresentação. Acredito que o analito escolhido tenha características básicas, com pka alto, não é? Pois os melhores resultados foram com os monomeros funcionais com caracterísitcas ácidas, todos ácidos. As vezes, valeria nesse caso fazer uma buscar por mais monomeros ácidos ao invés dos básicos. Vocês pretendem calcular os valores de Delta G? Os valores de energia apresentados são bem altos. Achei bem interessante o teste de seletividade.
Abordagem
Publicação: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Boa tarde, Thais. Parabéns pelo trabalho!
Vocês chegaram a levar em consideração alguma correção de dispersão nos cálculos em algum momento? Acho que isso pode ser importante na descrição dessas energias de interação entre o template e os monômeros. O ORCA tem uma gama de possibilidades interessantes para se fazer isso.
Vocês têm intenção de abordar o sistema polimerizado também (A partir dos monômeros obtidos melhores candidatos)? Você acha que seria possível, por exemplo, com QM/MM?
Ao final, como eles podem ser utilizados como sensores? Vocês também selecionam monômeros com alguma propriedade específica que se altera e pode ser medida quando a molécula de interesse se liga nessa cavidade?
Obrigado!
Sugestão
Publicação: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Primeiramente, parabéns pelo trabalho! Dado que vocês estão fazendo o design dos receptores artificiais, será que não seria bom, também, calcular a energia livre (\Delta G) de formação do complexo receptor-MDMA? Eu entendo que (1) o tamanho dos oligômeros pode ser um gargalo e (2) a energia de interação contém informação relevante a respeito da interação entre o receptor e o ligante, mas dado que os receptores podem se comportar de maneiras distintas no solvente (água, eu presumo), não seria importante também calcular uma quantidade mais diretamente relacionada a constante de equilíbrio?
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