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Publicação: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Olá Thais
Bem interessante o trabalho de vocês, parabéns.
Vocês estão planejando também calcular a interação
entre o MDMA e oligômeros ou polímeros do monômero
escolhido?
Abraços
Paulo Netz
estrutura para QM/MM e docking
Publicação: Cálculos QM/MM ONIOM para a obtenção de informações sobre inibidores da toxina A da ricina (RTA)
Olá Acassio
Bem interessante o trabalho de vocês. Parabéns.
Vocês chegaram a submeter o último frame da dinâmica a uma
minimização prévia, antes do cálculo ONIOM?
Além disso, chegaram a testar programas de docking
para ver se o docking reproduz o ranking experimental
(embora o cálculo de vocês seja superior ao docking,
claro).
Abraços
Paulo Netz
dinâmica molecular
Publicação: Modo de Ligação entre a Proteína Dissulfeto Isomerase A1 e seu Oxidante Hidroperóxido de Urato – Um Estudo Computacional.
Olá Antônio
Bem interessante o trabalho de vocês. Senti um pouco de falta dos detalhes
do protocolo de dinâmica molecular (poderia ser só uma tabela ou mencionar
o tamanho da simulação etc).
Abraço
Paulo Netz
parabéns
Publicação: Previsão ultra-rápida da estrutura secundária de proteínas a partir de sequências únicas empregando redes neurais profundas
Olá Guilherme
Parabéns pelo trabalho de vocês, está excelente!
Abraço
Paulo Netz
Resíduos conservados
Publicação: Docking molecular para avaliar a bioatividade d a Estavudina , Grazoprevir, Lamivudina, Oxifenisatina, Remdesivir, Rimantadina e Tenofovir contra a COVID-19
Olá Jorge Maurício
Interessante o trabalho de vocês.
O que você quer dizer com "resíduos conservados"? Normalmente
esta denominação é aplicada a estudos comparativos de proteínas
com mutação.
Abraço
Paulo Netz
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