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Metodologia - Docking
Publicação: Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana.
Oi, Letícia. Parabéns pelo seu trabalho! Vocês realizaram a reancoragem molecular para validar seu protocolo? Para o NCI, vocês recortaram apenas o sítio de ligação com o fármaco ancorado? Como foi feito? -
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pH fisiológico
Publicação: Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana.
Nas conclusões fala-se da importância do pH fisiológico para os estados de protonação. O pH fisiológico foi considerado nos cálculos ou utilizou-se apenas os estados protonados em fase gás? Considerou-se efeito de algum solvente? -
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Perspectivas
Publicação: Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana.
Oi Letícia! Parabéns pelo trabalho. Nos cálculos quânticos você chegou a calcular índices de reatividade das moléculas, do tipo ligante, como, por exemplo, potencial químico e eletronegatividade? Existe previsão da realização de simulações de dinâmica molecular? -
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Metodologia e Resultados
Publicação: Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana.
Olá, Letícia! Gostei muito da sua apresentação, parabéns! Você chegou a fazer o método de ancoragem em outros cristais da mesma enzima? Se sim, você chegou a fazer crossdocking? Se sim, a partir desses resultados, você consegue racionalizar, mesmo que quantitativamente, fingerprints químicos que podem estar relacionados à inibidação da enzima? -
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Sobre seu trabalho
Publicação: Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana.
Olá, parabéns pelo trabalho e apresentação. Eu fiquei com umas dúvidas: 1. Qual programa você rodou os cálculos quânticos? 2. Para os cálculos quânticos você usou fragmentos da proteína ao redor dos ligantes ou foi só para o ligante? 3. Para os cálculos quânticos você otimizou a geometria? Mais uma vez parabéns. Gerd Rocha
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