Cálculo SCRF e modelo SMD
Publicação: Theoretical study of the formation of inclusion complexes between a set of flavonoids and β-cyclodextrins, pure and modified.
Olá Maria Clara! Primeiramente parabéns pelo trabalho! Tenho algumas dúvidas. Quando você menciona um cálculo posterior SCRF com keyword SMD o que você quer dizer? No meu entendimento parece que a inclusão do solvente a partir do modelo "Reaction Field" foi feito posteriormente ao cálculo DFT, é isso? Minha outra dúvida é: qual é esse modelo de solvatação do Truhlar e qual sua relação com os cálculos SCRF?
Cálculos de interação e suficiência da determinação dos índices de reatividade
Publicação: Reactivity of three different bioactive molecules through a density functional theory study
Oi João! Parabéns pelo trabalho! Vocês realizaram ou planejam realizar cálculos da interação das moléculas com os clusters de Ti? Você acredita que os índices de reatividade calculados são suficientes para ter um entendimento qualitativo da reação ou eles servem mais de base para outros estudos?
Estados de transição de baixa energia e inclusão de correlação dinâmica.
Publicação: Ab initio study on the reactions of phosphorus-bearing molecules in the interstellar medium
Olá Carolina, parabéns pelo trabalho. Gostaria de fazer algumas perguntas:
1) No slide com os possíveis mecanismos de reação você mostra o estado de transição OPH-1A' com energia 0 e os outros com energia positiva enquanto o eixo vertical do gráfico indica a quantidade "Energia". Esse eixo é de fato energia ou é energia relativa (ΔE)? Tendo em vista isso, por que vários estados de transição têm energia menor do que o produto e ainda assim o produto é formado?
2) No geral cálculos CASSCF não são muito acurados para obtenção da energia total pois fora do espaço ativo não há inclusão de correlação dinâmica. Seus cálculos CASSCF tiveram algum tipo de correção perturbativa para inclusão da correlação dinâmica e melhora das energias?
Energy shit in TDDFT spectra
Publicação: Comparing Transition Potential and Linear Response TD-DFT Methods to Simulate X-ray Absorption Spectra for CO Desorbing from Ru(0001)
Hi Gabriel, very nice work! Probably TDDFT do not reproduce the correct vertical energy. Did you use any energy shift in your theoretical spectra? If so, do you use the same shift along the CO-surface distance?
cluster
Publicação: Comparing Transition Potential and Linear Response TD-DFT Methods to Simulate X-ray Absorption Spectra for CO Desorbing from Ru(0001)
Hi Gabriel! I enjoyed a lot watching your video and learned a few things about Xray spectroscopic! You are going in an insightful research direction, instead of just crunching out numbers. I appreciate that, and frankly I wish I had the opportunity of doing that more often in my group. Congrats! The clusters are rigid at their experimental bulk equilibrium distances?
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