Dúvidas sobre a relação água/inibição do RNA
Publicação: Theoretical study of tautomerization mechanism and drug potential of halogenated Favipiravir compounds for COVID-19 treatment
Caro Daniel, parabéns pelo trabalho! Ele envolve um tema extremamente atual e relevante para a nossa sociedade.
Gostaria de entender melhor o seu trabalho. Pra mim, não ficou clara essa relação direta das interações com moléculas de água
ser tão determinante e conclusivo na tautomeria apresentada e sua relação com as propriedades inibitórias do RNA.
Muito obrigado.
Perguntas
Publicação: Theoretical study of tautomerization mechanism and drug potential of halogenated Favipiravir compounds for COVID-19 treatment
Parabéns pelo trabalho apresentado.
Vocês cogitam a possibilidade de realizar esse scan no ambiente da proteína, usando um método de QM/MM? Se sim, qual seria a estratégia?
Até mais,
Gerd Rocha
Programa de docking e curiosidades
Publicação: Theoretical study of tautomerization mechanism and drug potential of halogenated Favipiravir compounds for COVID-19 treatment
Olá Daniel, parabéns pelo trabalho e apresentação. Algumas dúvidas/curiosidades. Qual programa você utilizou para realizar o docking? Acredito que se você mostrasse algumas poses principais do resultado de docking poderia ficar mais fácil para analisar os resultados, pois como é conhecido, confiar nos scores obtidos por docking não é algo muito usual, devido a não consideração de entropia, solvatação, etc. Além disso eu me recordo que os testes clínicos fase 3 foram iniciados para o Favipiravir no início do ano, sabe de algo sobre esse estudo? E ainda não foi descoberto o mecanismo pelo qual o Favipiravir impede a replicação viral de alguma maneira? Obrigado!
Estrutura dos compostos
Publicação: Theoretical study of tautomerization mechanism and drug potential of halogenated Favipiravir compounds for COVID-19 treatment
Olá Daniel, excelente apresentação.
Como foram obtidas as geometrias com as moléculas de água? Foi feito o IRC ou algum outro processo de varredura?
Foi considerado um modelo de solvente contínuo, como PCM?
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