Todas as atividades (49)
Outros

Rogério Custodio respondeu o tópico "Escolha do pseudopotencial"

Publicação: Entalpias de formação para compostos de iodo obtidas exclusivamente através de métodos DFT

Oi, Maria Andreizi, muito legal vocês estarem se preocupando com possibilidades de obtenção de bons resultados de propriedades para compostos de iodo. Vai ter uma clientela muito grande em função da falta de condições apropriadas para cálculos desses compostos. Minha dúvida é em relação a escolha do pseudopotencial: Por que o lan? Em geral essa escolha é por causa do efeito relativístico. Mas, a função de base é pequena, normalmente CEP ou SBK dá um resultado melhor e tem um conjunto de base melhor e, finalmente, a perda relativística pode ser compensada por algum ajuste empírico do tipo HLC (por exemplo). O pessoal também vive falando para considerar o uso do pseudopotencial de Sttutgart-Dresden-Bonn, mas não tenho obtido resultados tão bons com esses pseudopotenciais para entalpias de formação. Se bem que ele tem uma flexibilidade de funções de base que chama a atenção (. Chem. Phys. 114, 3408 (2001)). Em resumo, por que não o CEP?

Parabéns pelo trabalho e mande um grande abraço para o Régis e outro para você.

Outros

Evandro Paulo Soares Martins respondeu o tópico "Sobre a metodologia"

Publicação: AVALIAÇÃO DE FUNCIONAIS DFT NA PREDIÇÃO ESTRUTURAL DE COMPLEXOS DE Bi(III) COM LIGANTES DITIOCARBAMATOS

Oi Evandro

 

Parabéns pelo seu trabalho!

Por favor, eu tenho algumas dúvidas, você poderia esclarecê-las?

 

Você comparou a qualidade dos funcionais com base nas geometrias otimizadas (supus que fosse no vácuo) com as geometrias cristalográficas. Entretanto, o ambiente no cristal é muito diferente do ambiente em vácuo. Você não teme estar classificando os funcionais de forma errônea? Eu digo isso porque já fiz cálculos com um composto que apresentava uma inversão nos comprimentos de ligação entre o cristalográfico e os resultados obtidos por EPR. Ou seja, os cálculos concordavam com um dos métodos experimentais mas não com o outro.

 

Um abraço

 

Eduardo

Outros

Vinícius Bonatto respondeu o tópico "Comentário sobre o trabalho"

Publicação: Intermolecular Covalent Interactions: A Unified Framework for Pnictogen-, Chalcogen-, Halogen-, and Hydrogen Bonds

Oi Lucas, ótima apresentação e trabalho bem relevante! Tenho muito interesse neste tópico, pois muitas vezes, ao propor novos inibidores (candidatos a fármacos) uma maneira interessante de alcançar seletividade frente a outros alvos, é explorando estes tipos de interações (principalmente, halogênio e calcogênio). Porém, no meu caso, para simular estes tipos de interações ao analisar complexo inibidor-enzima por dinâmica molecular, utilizamos um ponto extra de carga positiva para representar o sigma-hole, até hoje, não tivemos problemas com essa aproximação. Gostei bastante do trabalho feito por vocês, bem interessante. Parabéns!

Outros

Matheus de Oliveira Bispo respondeu o tópico "física dos funcionais"

Publicação: Long Range Parameter Optimization For The Description Of Potential Energy Surfaces Using Density Functional Theory

Caro Matheus, parabéns peo trabalho!

 

Você utiliza funcionais bem diferentes, certo? Por exemplo, o wB97XD é híbrido e tem correção de dispersão, ao contrário do PBE

 

Ao otimizar o parâmetro de longo alcance você está corrigindo qual deficiência dos funcionais? Sempre a mesma deficiência em todos os casos? Os valores ótimos de w são semelhantes para diferentes funcionais?

 

Obrigado

 

Marcio

Outros

Luis Antonio Guallichico Guallichico respondeu o tópico "Pergunta do Renan Ribeiro - Dúvidas"

Publicação: Passivação de Perovskitas de Iodeto de Metilamônio e Chumbo com moléculas orgânicas: o caso da molécula 4-terc-butil piridina (TBP)

Caro Renan , peçao disculpas, estou colocando aqui o seu tópico, já que ontem que eu tentei responder as suas perguntas não sei como cliquei em esconder topico e não apareceu mais, mas por sorte esse tópico chegou no meu e-mail. A seguir o seu tópico:

 

Olá Luís, belíssimo trabalho e apresentação. Parabéns!

 

Após a adsorção vocês notaram uma boa transferência de carga entre a superfície e o TDP. Houve alguma localização específica dessa transferência de carga?

 

Além disso, gostaria de saber se vocês pensam em considerar o íon F- também nas simulações, visto que é um halogênio que usualmente contribui para o aumento da estabilidade de perovskitas híbridas.

 

Aqui na UEMG estamos trabalhando com simulações de superfícies para ações catalíticas e magnéticas, será um prazer discutir os resultados com vocês. Um abraço.

Outros

Pollyanna Pinto Maia respondeu o tópico "Correção de dispersão"

Publicação: Polímero de Impressão Molecular para o Atenolol: Um Estudo Teórico.

Outros

Matheus de Oliveira Bispo respondeu o tópico "Congratulações e dúvidas sobre a otimização"

Publicação: Long Range Parameter Optimization For The Description Of Potential Energy Surfaces Using Density Functional Theory

Olá, Matheus! Primeiramente, gostaria de te parabenizar muito pelo trabalho! Achei que sua apresentação ficou incrível, slides bem claros, bonitos e didáticos, fora que sua dicção foi super clara.... parabéns mesmo!!

Como o vídeo é curtinho, sempre sobram dúvidas, então eu fiquei me perguntando: de onde surgiu aquelas curvas 'pré-otimização' que você mostrou? Você rodou os cálculos utilizando o valor de omega padrão e depois comparou com aquele que você otimizou, foi isso mesmo?

Outra dúvida foi: como foi feita essa otimização? Entendi que você escolheu um algoritmo para otimizar e usou duas métricas de erros, mas queria entender um pouquinho melhor como é a lógica dessa otimização, pois não conheço trabalhos assim.

Novamente, parabéns!