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Rodolfo Enrique Izquierdo Soto e outra pessoa responderam o tópico "Congratulations and questions, Rodolfo Izquierdo TCG– UFRGS"

Publicação: Role of coulomb interactions and density on the viscosity and non-newtonian behavior of ionic liquids – a molecular dynamics study

Good afternoon, congratulations, . Dr. Bernardino, the chemical modification of the cations in ionic liquids could guide their application as new materials for catalysis and more recently as materials for the storage of gases. How is the performance of your models in the presence of cations with greater structural complexity, i.e., larger and substituted cations?

I know that is not the focus of your research, however, with the goal of in silico design of new ionic liquids, do you know of any precise theoretical description model for melting and boiling points for complex ionic liquids?

 

Thank you, excellent presentation.

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Kalil Bernardino respondeu o tópico "Correlação entre DFT e modelos "clássicos" e possíveis efeitos de solventes"

Publicação: Em busca de nanoestruturas estáveis de fluoreto de lítio

Boa tarde Henrique, parabéns pelo trabalho!

Uma curiosidade: Na geração dos clusteres, foi calculada inicialmente a energia usando o potencial de Coulomb-Born-Mayer, que é um potencial parametrizado. O quão bem os resultados obtidos posteriormente com DFT se correlacionam com as energias resultantes desse primeiro cálculo? Penso que isso pode ser interessante tanto para indicar a presença ou não de possíveis efeitos de estrutura eletrônica nas nanoestruturas como avaliar a viabilidade de modelos clássicos no estudo desse sistema.

A outra sugestão é que deve ser interessante avaliar possíveis efeitos de solvente, já pensando num possível processo de síntese desses nanopartículas. Dado ao fato de ser iônico, imagino que as estabilidades de diferentes estruturas possa mudar em um solvente de alta constante dielétrica.

Grato,

Kalil

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Murillo Halo Queiroz e outra pessoa responderam o tópico "Transferência de carga"

Publicação: Interações do dímero de água com naftaleno: Implicações da microssolvatação nos espectros vibracionais e na cinética de reorientação intermolecular

Caro Murilo,

     Primeiramente, parabéns pelo trabalho! Na formação de h-bond do tipo: X-H---Y ocorre transferência de carga e Y para o oscilador X-H o que leva a um red shif na frequencia e um aumento da intensidade do oscilador X-H. Essa carga transferida pode se facilmente quantificada pelo somatório da cargas atômicas (por exemplo APT) num nos monômeros no complexo de hidrogênio. Você observou efeitos significativos de transferência de caga nos seus sistemas? Segue uma referência que pode lhe interessar Araujo, R.C.M.U. et al. Spectrochimica Acta, Vol. 51A, No. 5, pp. 821-830, 1995.

Abraço para ti e para Rivelino. Bosco

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Leonardo Viana das Chagas Lima respondeu o tópico "Rescoring de poses de docking melhoram a capacidade preditiva"

Publicação: Dock2ONIOM: Utilitário Python para Rescoring de Poses de Docking Molecular pelo Método ONIOM

Boa noite Léo! Trabalhado extremamente relevante.

Tenho uma dúvida sobre o reescoring para melhorar a capacidade preditiva.

No docking molecular, normalmente, o reescoring é usado em protocolos de consenso. Ou seja, utilizamos uma função para a busca e ranqueamento das melhores poses (conformações do ligante) e, na sequencia, usamos outra função para fazer o re-ranqueamento. Então, comparamos a melhor pose obtida com a primeira função de pontuação com a segunda. Nesse caso, duas coisas podem ocorrer: (1) As duas funções acusam a mesma pose como a melhor; (2) A segunda função atribui melhor pontuação a uma pose diferente da primeira. Nesse último caso, utilizamos a pose com melhor pontuação apontada no re-ranqueamento.

Essa é uma forma de eliminar falsos positivos. Então, como se dá essa verificação no programa que está trabalhando?

Desde já agradeço.

Maurício Brito

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Amanda Dornela Torres e outra pessoa responderam o tópico "Caráter Multireferência"

Publicação: Revisitando a estrutura eletrônica do [Co(CN)6]3-

Oi, Amanda! Parabéns sobre o excelente trabalho! Tenho algumas perguntas!
(que, acredito, não foram respondidas pela limitação do tempo da apresentação mesmo)

1) Sobre o caráter multirreferência do problema eletrônico: É esperado que o caráter multirreferência seja encontrado no estado fundamental ou nos estados excitados? Qual é o perfil de ocupação dos orbitais naturais obtidos?

2) Sobre os resultados CASSCF/NEVPT2: Como foram obtidos os estados excitados utilizando estes métodos?

3) Sobre o modelo de acomplamento vibrônico: Quantos pontos são necessários por modo normal? Quantos cálculos foram realizados neste procedimento para se simular o espectro?

Obrigado!

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Frederico Henrique do Carmo Ferreira e 4 outras pessoas responderam o tópico "Congratulações e dúvidas"

Publicação: Proposition of Cr3+, Mn2+, Fe2+, Co2+, Ni2+, Cu2+, Zn2+ complex structures with glycine: A structural and electronic approach

Olá, Frederico! 

Gostaria de te parabenizar pela apresentação! Esse modelo é bem diferente, trás vários elementos que lembram uma apresentação mais voltada pra Divulgação, então deixa o assunto mais leve e interessante! Ainda mais pra um congresso grande, com pessoas de várias áreas. Fora sua dicção, que é incrível! Meus parabéns!

Eu fiquei com uma dúvida: quais seriam as etapas seguintes do trabalho? Vocês têm algum objetivo específico ao estudar esses complexos com metais, ou seria mais uma caracterização in silico?