Anais do Simpósio Brasileiro de Química Teórica
Anais do XXI Simpósio Brasileiro de Quimica Teórica - Vol. 1 2021

Olá Heloisa, seu trabalho é extremamente interessante e parece bem desafiador em especial no caso do cobre. Não sei a melhor forma de usar essa ferramenta, então separarei as perguntas em tópicos diferentes.

Quanto aos sistemas escolhidos: Vejo as similaridade dos sistemas contendo antimônio e bismuto, previamente estudado pelo grupo e com uma parceria experimental. O cobre por outro lado possui carga e configuração de valência diferentes dos anteriores. Além disso, metais de transição 3d são conhecidos pela dificuldade na descrição de métodos computacionais. Qual a motivação de estudar o sistema de cobre? Há estudos experimentais sobre eles?

Parabéns pelo trabalho, Fernanda.

Você tem algum problema de contaminação de spin nesse tipo de complexo? Se sim, como você trata isso?

Obrigado.

Oi Fernanda, boa noite.

Quero parabenizá-la pelo excelente trabalho. Adorei.

Boa noite Fernanda,

Parabéns pelo trabalho! Embora ele esteja no início, é possível perceber seu impacto e importância.

Tenho uma dúvida sobre seu trabalho. No cálculo do potencial padrão, você usou a equação de Nernst calculando o DeltaG = Gox - Gred, levando em consideração a expressão 2. Tenho duas perguntas para você:

- Como você imagina que seus resultados podem ser melhorados: mudança de base, correção de 1 atm -> 1 M, inclusão de efeito relativístico com ZORA etc.?

- Quais multiplicidades você usou nas otimizações para os complexos de Ru?

Saudações Sr. Mauricio e o parabenizo pela execlente exposição.

É mencionado em sua apresentação "outras patologias" e são citadas algumas patologias: hepatite B e C, HIV1 e influenza A. Existem outras patologias além dessas citados?

Olá Laura, muito interessante seu trabalho. Qual o tamanho do sistema que vocês usaram? Foi exatamente aquela imagem do início? Um pouco mais de uma hora é um tempo excelente para um sistema com muitos átomos de La. 

Excelente apresentação.

Uma dúvida sobre  o Ru-II e Ru-III,  o número de coordenação é o mesmo para os dois íons?

Para incluir as aproximações relativísticas foi usando o método ZORA ou DKH2 ? Ou outro procedimento foi adotado? No final, a aproximação relativística foi importante em seus resultados?

Parabéns pelo trabalho Yuri. Você usou ou pretende usar algum solvente nos cálculos para analisar essa interação em diferentes meios?

Olá Caio, boa noite.

Você acha que seria interessante para o seu estudo utilizar outros solventes? Porque?

Oi, Maria Andreizi, muito legal vocês estarem se preocupando com possibilidades de obtenção de bons resultados de propriedades para compostos de iodo. Vai ter uma clientela muito grande em função da falta de condições apropriadas para cálculos desses compostos. Minha dúvida é em relação a escolha do pseudopotencial: Por que o lan? Em geral essa escolha é por causa do efeito relativístico. Mas, a função de base é pequena, normalmente CEP ou SBK dá um resultado melhor e tem um conjunto de base melhor e, finalmente, a perda relativística pode ser compensada por algum ajuste empírico do tipo HLC (por exemplo). O pessoal também vive falando para considerar o uso do pseudopotencial de Sttutgart-Dresden-Bonn, mas não tenho obtido resultados tão bons com esses pseudopotenciais para entalpias de formação. Se bem que ele tem uma flexibilidade de funções de base que chama a atenção (. Chem. Phys. 114, 3408 (2001)). Em resumo, por que não o CEP?

Parabéns pelo trabalho e mande um grande abraço para o Régis e outro para você.

Parabéns pelo trabalho e pela apresentação. (1) - Você poderia quantificar o efeito substituinte medindo a área sob os gráficos das suas propriedades (tamanho de poro,  area especifica etc). O que acha disto ? (2) -  O que acha de estudar as moléculas individuais, e quantificar com algum descritor o efeito substituinte ? Depois você poderia usar até a teoria de Hammett para buscar correlações (seu orientador a conhece muito  bem), ou correlacionar estes resultados com os seus do cristal. Grande abraço e sucesso !

Oi Felipe, parabéns pela apresentação, muito fluida e fácil de acompanhar. Me responde uma coisa, você mencionou que usou o Chargemol para calcular cargas DDEC6 para esses materiais, mas não mostrou (ou não vi) os resultados dessas cargas. O que elas revelaram? Eu estive envolvido com as cargas (e dipolos atômicos) DDEC6 recentemente, e a conclusão que chegamos é que as cargas, enquanto escalares, podem trazer informações limitadas sobre a distribuição da densidade eletrônica em uma molécula ou grupo funcionar. É importante levar em conta as possíveis assimetrias dessa distribuição eletrônica que são caracterizadas por dipolos atômicos e multipolos de maior ordem, quando preciso. Se for olhar as cargas DDEC6, não deixe de olhar os dipolos atômicos também. Eles saem logo ao lado das cargas no output do Chargemol. Forte abraço!

Fala Felipe! Belo trabalho! Poderia falar um pouco sobre a estabilidade termodinâmica das estruturas geradas? Como você calculou a entalpia de adsorção? Parabéns!

Olá Daniella, muito interessante seu trabalho, parabéns. Você analisou a distribuição de carga gerada pela NBO? Se sim, houve alguma informação relevante nela? Se não, acha que poderia haver?

Olá Jorge Maurício! Parabéns pelo seu trabalho dentro de um tema tão atual. Além de uma apresentação bastante detalhada.

Boa tarde Felipe! Primeiramente, parabéns pela qualidade dos slides e clareza na exposição dos mesmos! Minha primeira questão é com relação a etapa de Monte Carlo realizada. Nessa etapa, a estrutura dos COFs é mantida rígida conforma a obtida nos cálculos anteriores? Fico pensando se talvez a estrutura do COF não possa relaxar após adsorver o gás, melhorando ainda mais a entalpia de adsorção e talvez até aumentando a quantidade de moléculas adsorvidas. Isso talvez seja mais relevante para os grupos funcionais de menor simetria, que poderiam mudar de conformação na presença do gás. Talvez isso possa ser respondido fazendo algo interativo, ou seja, uma vez feita a inclusão do gás no MC, retornar as primeiras etapas com o CP2K, reotimizar com as moléculas do gás e tentar um novo ciclo de monte carlo e ver se as propriedades mudam.  

Grato,

Kalil

Olá Felipe, parabéns pelo trabalho, muito interessante o tema! Fiquei com uma dúvida sobre o programa ChargeMOL (eu não o conheço) que tipo de informação vinda do CP2k (ou de outro software) você precisa para fazer esse cálculo?

Hi Luan, very nice work, congrats!
For the rate conefficients you also need the partition functions, besides the barrier heights.  For that you might have used vibrational frequencies and geometries, but  are those CBS extrapolated?

It should be possible to obtain these properties at the CBS limit, and only then I would consider that the rate coefficients are truly at the CBS level. 

 

As energias de adsorção são dadas em qual unidade?

Hi Luan,

as I promised I heard about your project... It is quite nice - however, I was surprised by the reaction you are evaluating. Do you know how to stop the oxidation process really in this stage?

Sincerely,

Jaroslav

Olá Felipe, parabéns pelo trabalho e pela apresentação. Vocês também avaliaram a capacidade desses sistemas atuarem como catalisadores em reações de redução do CO2, ou outras reações, além da captura? 

Olá Guilherme, parabéns pelo trabalho. Nessa etapa feita no GAUSSIAN, você pensou em utilizar outros níveis de cálculo para comparar com os seus resultados em DFT? Pergunto isso, pois recentemente obtive bons resultados utilizando HF nos meus trabalhos e seria interessante você fazer esta comparação.

Excelente trabalho xará, parabéns. Sobre os grupos N, F e Lofinas, eles foram escolhidos por algum motivo específico? Havia algum indicativo prévio que seria uma boa escolha?

Oi Evandro

Parabéns pelo seu trabalho!

Por favor, eu tenho algumas dúvidas, você poderia esclarecê-las?

Você comparou a qualidade dos funcionais com base nas geometrias otimizadas (supus que fosse no vácuo) com as geometrias cristalográficas. Entretanto, o ambiente no cristal é muito diferente do ambiente em vácuo. Você não teme estar classificando os funcionais de forma errônea? Eu digo isso porque já fiz cálculos com um composto que apresentava uma inversão nos comprimentos de ligação entre o cristalográfico e os resultados obtidos por EPR. Ou seja, os cálculos concordavam com um dos métodos experimentais mas não com o outro.

Um abraço

Eduardo

Oi Keyla

Parabéns pelo seu trabalho!

Eu gostei muito da abordagem e da filosofia dele mas, não tenho certeza de ter entendido todos os detalhes e minúcias. Por favor, você poderia esclarecer-me algumas dúvidas?

1) Onde entra explicitamente o efeito da temperatura? Eu acho acredito que não seja nos cálculos das energias dos osciladores porque não há "espaço" na equação de Schrodinger, ou qualquer outra que dela seja originada, para entrar-se com temperatura.

2) Por que você escolheu as transições do estado tripleto? Você fez uma análise  da interação entre o acoplamento vibracional com os níveis eletrônicos?

3) Pelo que eu vi, você considerou (4´12") que a forma da curva de energia potencial era simétrica, ou seja, as anarmonicidades froam desconsideradas. A aplicação da metodologia se elas fossem consideradas ficaria tão mais difícil ou complicadas se este fator fosse considerado?

Obrigado por sua atenção

Eduardo

Parabéns pelo trabalho Vanessa. Você pretende testar outros solventes além do etanol para analisar como eles influenciam no espectro?

Olá Matheus. A gente colabora tem um tempo e ainda nao tinha visto uma talk sua, foi muito bom ouvir um pouco mais de detalhes sobre seus métodos. Parece bem sofisticado.  Minha questão é: De onde veio  o nome bonitrol? rsrs

Boa tarde, Guilherme. Parabéns pelo trabalho!

Essas condições de contorno criadas têm alguma interpretação no seu problema físico?

Obrigado!

Parabéns pelo trabalho Incrível!!!!

Teria como adicionar efeito solvent explícito? Imagino que esse tipo de efeito mudaria a altura da barreira.

Eu tento trabalhar com efeito solvente. Pensei em colocar com densidade de cargas pela metodologia ASEC, caso o Sr. tenha interesse em colaborações. 

Oi Mariana! Parabéns pelo seu trabalho! Muito legal!

Olá Karine.

Parabéns pelo excelente trabalho.

Existem na literatura propostas de investigação de reações de substituições nucleofílicas similares, porém usando métodos QM/MM.

Maiores informações:

"Comparison of Free-Energy Methods to Calculate the Barriers for the Nucleophilic Substitution of Alkyl Halides by Hydroxide
by Hafiz Saqib Ali, Jonathan Higham, Sam P. de Visser*, and Richard H. Henchman*
Cite this: J. Phys. Chem. B 2020, 124, 31, 6835–6842
Publication Date:July 10, 2020
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c02264

Eu gostaria de sugerir que, se possível, você investigasse e comparasse os seus resultados com tais métodos.

Muito obrigado.

Olá Mariana, parabéns pelo trabalho! Gostei bastante da sua apresentação. Gostaria de saber o que são e como foram obtidos os valores para \rho_{FC}?

Desde já agradeço e desejo muito sucesso na sua carreira!

Obrigado!

Suzane, você tem alguma teoria sobre o motivo do farmaco 12 ter demosntrado os melhores resultados na eliminação das amastigotas? Parabéns pelo trabalho.

Olá Débora.

Parabéns pelo trabalho.

Eu gostaria de sugerir que, se possível, você avaliasse ou até mesmo entrasse em contato com os autores e consultasse a base de dados de reações interestelares pois há algumas iniciativas em montar base de dados sobre reações inversas ou similares ao que você está estudando. Maiores informações:

"The UMIST database for astrochemistry 2012"
by D. McElroy, C. Walsh, A. J. Markwick, M. A. Cordiner, K. Smith and T. J. Millar
Astronomy and Astrophysics 550, A36 (2013)
https://doi.org/10.1051/0004-6361/201220465

A no link abaixo, selecionando as moléculas, você poderá encontrar dados de algumas reações:
"UMIST RATE2012 / astrochemistry.net"
http://udfa.ajmarkwick.net/index.php

Outra sugestão é dê uma olhada no trabalho:

"Chemical Modeling For Predicting The Abundances Of Certain Aldimines And Amines In Hot Cores"
by Milan Sil, Prasanta Gorai, Ankan Das, Bratati Bhat, Emmanuel E. Etim, and Sandip K. Chakrabarti
Astrophysics of Galaxies
https://arxiv.org/abs/1711.10198
[last revised 14 Apr 2021 (version, v3)]

Muito obrigado.

Parabéns pelo trabalho. Acho extremamente relevante entender reações em meio interestelar, uma vez que os elementos são originários dele. Você sabe dizer se há trabalhos para outras moléculas utilizando essa metodologia?

Boa tarde, Deborah. Parabéns pelo seu trabalho! A contextualização que você fez ficou muito boa.

Pegando um gancho na pergunta do Mateus Augusto, a determinação de barreiras de energia entre as espécies que você está estudando vai ser muito importante para o seu trabalho, ainda mais que você pretende estabelecer um modelo cinético. Dê uma olhada no pacote ORCA, além de gratuito, ele tem umas opções interessantes (como o NEB e o ScanTS) que podem te ajudar a obter as devidas conexões entre os intermediários, reagentes e produtos das reações de seu interesse, além de encontrar os estados de transição entre eles.

Sucesso no seu projeto!

Camilla, parabéns pelo trabalho. Muito interessante. Eu não conhecia essa classe de composto em específico. 1) Eles se comportam como isolantes? 2) A susceptibilidade magnética é conhecida? 3) Você poderia me mandar o input do gaussian da estrutura? 
meu e-mail: [email protected]

Olá Caio, parabéns pelo trabalho. Muito bacana sua apresentação.

Vocês verificaram ou pretendem estudar diferentes geometrias para os poros e o seu efeito sobre as propriedades?

Ola Francisco, parabens pelo trabalho. Gostaria de voce comentasse se foi avaliada viabilidade de calculos com conjuntos de bases menores como def2-def2-SVP ou def2-SVPD e tambem se foi avaliado se ha diferencas significativas nos seus resultados com a introducao de funcoes difusas nesse conjunto de base (def2-TZVPD). Obrigado 

Olá David, tudo bem? Sei que não é o foco do trabalho, mas vi que você tem um excelente domínio do método, você saberia dizer se há a possibilidade de obter as ocupações (Occupancy) dos orbitais de valência usando essa metodologia? Parabéns pelo excelente trabalho. 

Otimo trabalho Guilherme! Fiquei pensando se voce consegue relacionar o overlap a I'm Delta learning na energia.

Francisco, muito bom seu trabalho. Você conclui que o funcional TPSSh seria o mais indicado na predição. Se você usasse diferentes bases, acha que isso iria se manter? 

Oi Lanna, parabéns pelo trabalho, achei muito interessante. Gostaria de saber se outros valores de pH foram simulados.

Desde já agradeço e desejo muito sucesso na sua carreira!

Obrigado!

Olá Guilherme, parabéns pelo trabalho, muito interessante esta abordagem de aprendizado de máquina para estimar os descritores.

Gostaria de saber qual método de estrutura eletrônica foi utilizado para estimar o \Psi_minD.

Desde já agradeço e desejo muito sucesso na sua carreira!

Obrigado!

Olá Ricardo, muito bom seu trabalho. Um dúvida. Você diz que o fósforo induz uma quebra de planaridade. 1) O forte efeito que você diz ser causado pelos átomos de N e Cl é análogo ao do fósforo? 2) Você testou ou pretende testar o efeito de outros átomos na estrutura? Parabéns pelo trabalho!

E um comentário off topic: O Henrique parece muito com o Tony Stark.

Parabéns pelo trabalho e apresentação, Geisenely.

Qual erro ou desvio padrão nas medidas teóricas comparadas com as experimentais?

E vocês pretendem expandir os estudos incluindo efeitos do solvente (implícito e/ou de forma explícita)?

Obrigado e parabéns mais uma vez.