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INDOL-THIAZOL DERIVATIVES: DNA INTERACTION AND DOCKING STUDIES
Franciane Gonçalves dos Santos
Universidade Federal de Pernambuco-UFPE/ Departamento de Química Fundamental-DQF
Now you could share with me your questions, observations and congratulations
Create a topicAgents that act on DNA are object of study in the development of chemotherapic agents. In this context, seven indole-thiazoles were evaluated in silico and in vitro as DNA ligands.
Ana Paula Ruani
Olá Franciane
Parabéns pelo trabalho e pela apresentação :-)
Gostaria de saber qual(is) o(s) software(s) utilizado(s) nos estudos de Molecular docking com DNA e de que maneira o hipercromismo está associado à interação no sulco?
Obrigada pela atenção
Ana Paula
Gustavo Augusto Assis Faustino
Parabéns pelo trabalho desenvolvido e ao grupo.
Franciane Gonçalves dos Santos
Olá Gustavo! Muito obrigada!
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Franciane Gonçalves dos Santos
Olá Ana Paula, Obrigada!
Em relação ao tratamento de dados do estudo de docking, foram utilizados os seguintes programas: Discovery Studio 2017, AutoDockTools, ChemDraw, Ultra 12.0, Avogadro e Mopac2016. Os receptores foram obtidos no banco de dados Protein Date Base (PDB). Para estudo de intercalação usou-se o DNA com a Topoisomerase IIα humana e para interação ao sulco, apenas o DNA.
E os estudos espectroscópicos junto com outras técnicas determinam o tipo de interação de pequenas moléculas com o DNA. No caso, de absorção no UV-vis para esse fim, a literatura sugere hipocromismo para intercalação e hipercromismo para as demais ( atração eletrostática, ligação covalente e interação no sulco). Com base na estrutura dos indol-tiazóis, entre esses três efeitos, só poderia ocorrer interação ao sulco. E o hipercromismo é observado quando há modificação na estrutura da dupla hélice, expondo a bases do DNA, levando um aumento da intensidade da banda de absorção máxima. Porém, mesmo com dados de Kb, essas informações não devem ser interpretados de forma isoladas. Mas, com base nessas informações de hipercromismo, podemos sugerir interação ao sulco.
Att.,
Franciane Gonçalves