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Ótimo trabalho/dúvida
Publicação: Application of computational tools in metabolomics of stingless bee honey
Olá Luís, gostaria de parabenizar pelo excelente trabalho e apresentação! Gostei muito. Tenho uma dúvida em relação ao uso do NAP, para acessar a essa ferramenta in silico, eu preciso processar primeiro na rede molecular clássica e somente depois utilizar a propagação de anotação? Gostaria também de utilizar com meus dados de LC-MS. Muito obrigada :) -
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Esfingosinas
Publicação: Application of computational tools in metabolomics of stingless bee honey
Parabéns pelo trabalho. Há relatos na literatura de que as esfingosinas são biossintetizadas por microrganismos e outros insetos? -
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Alinhamento dos picos
Publicação: Application of computational tools in metabolomics of stingless bee honey
Olá, Luis Parabéns pelo trabalho e excelente apresentação. Eu tenho uma dúvida quanto a construção das redes moleculares. Nesse caso, foi necessário alinhar os picos? Se sim, isso foi feito na própria plataforma ou você utilizou outro software? -
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Bancos de dados
Publicação: Perfil Químico de Citrus Sinensis enxertada em Citrus Limonia por ferramentas quimioinformáticas e UPLC-Qtof-MS/MS
Olá, Fernanda, ótimo trabalho e apresentação! Conheço poucas pessoas que que usam o KNapSAcK! Acho ele muito bom, dá pra fazer uma busca muito rápida sobre os metabólitos já descritos em um determinado organismo. Se atualizassem mais, poderiam melhorar os resultados. Os outros bancos de dados eu não conhecia, achei muito legais o PlantCyc e, principalmente, ANPDB. No entanto, não encontrei o database do UNPD. Poderia me ajudar? Obrigado. -
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Intensidade dos metabólitos
Publicação: Investigation of metabolic profile of common bean (P. vulgaris) treated with a biofertilizer obtained through fermentation of Corynebacterium glutamicum
Olá, Stephanie, gostaria de parabenizá-la pelo seu trabalho, resultados obtidos e apresentação. Gostei muito! Estou com duas dúvidas: 1. O que significa, especificamente, quando você diz que o metabólito foi observado em maior intensidade na amostra? Seria intensidade do sinal no TIC? 2. Você utilizou algum software para processamento dos dados antes de submetê-los à análise no GNPS? Muito obrigado.
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