Docagem
Publicação: Molecular Docking of Proposed Inhibitors for a Metalloprotease Associated with Schitosoma mansoni Infection
Boa Tarde Andrei, tudo bem?
Qual a diferença entre docagem e redocagem? Parabéns pelo trabalho, muito interessante.
Homologia Molecular
Publicação: Molecular Docking of Proposed Inhibitors for a Metalloprotease Associated with Schitosoma mansoni Infection
Olá, Andrei, parabéns pelo trabalho. Então vocês utilizaram a homologia molecular, mas, qual foi o percentual de similaridade dos resíduos de aminoácidos da enzima dos organismos vivos selecionados? Além disso, como vocês validaram o modelo de homologia para saber se era adequado ou não para o estudo? E por fim, vocês fizeram o estudo de docking molecular dos seus compostos e dois deles foram bons, contudo, qual foi o fiscore da substância de referência (ligante co-cristalizado) e qual programa vocês utilizaram para o cálculo do RMSD?
Processo de docagem
Publicação: Molecular Docking of Proposed Inhibitors for a Metalloprotease Associated with Schitosoma mansoni Infection
Olá Andrei, parabéns pelo trabalho! Fiquei com uma dúvida em relação a redocagem, porque quando se utiliza uma estrutura PDB, geralmente ela vem com um ligante. Mas no seu caso, foi elaborada a enzimas por padrões similares, que a princípio não contém ligante, certo!?. Então como foi validada a redocagem e o ponto exato de localização do ligante no sítio de interação da enzima?
Obrigada!
Ótimo trabalho!
Publicação: Molecular Docking of Proposed Inhibitors for a Metalloprotease Associated with Schitosoma mansoni Infection
Parabéns pelo trabalho desenvolvido.
Parabéns pelo trabalho desenvolvido.
Publicação: Molecular Docking of Proposed Inhibitors for a Metalloprotease Associated with Schitosoma mansoni Infection
Parabéns pelo trabalho desenvolvido e ao grupo.
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