Computational studies on inhibition of vivapains of Plasmodium vivax
Detalhes
- Tipo de apresentação: Apresentação de Pôster / Poster Communications
- Eixo temático: Dinâmica Molecular
- Palavras chaves: malária; drug design; molecular dynamics; Virtual Screening;
- 1 Universidade Federal do Rio de Janeiro
- 2 Department of Physics / Auburn University
Computational studies on inhibition of vivapains of Plasmodium vivax
Mariana Simoes Ferreira
Universidade Federal do Rio de Janeiro
Resumo
Investigate the structure of the vivapains in order to find potential inhibitors for them.
Build the tridimensional structures of vivapains through Comparative Modelling
Exploring interaction sites of vivapain 4 through molecular dynamics simulations.
Identify important residues interaction by different techniques, from clustering to mixed solvents.
Virtual screening to identify ligands and further investigate its interactions with vivapain 4.
Discussões Científicas de Qualidade
Com ~200 mil publicações revisadas por pesquisadores do mundo todo, o Galoá impulsiona cientistas na descoberta de pesquisas de ponta por meio de nossa plataforma indexada.
Confira nossos produtos e como podemos ajudá-lo a dar mais alcance para sua pesquisa:
Mariana Simoes Ferreira
Olá Rodrigo, muito obrigada!
Simulamos com este sistema pois, com a presença de grupamentos hidrofóbicos no solvente, conseguimos observar interações entre resíduos das cavidades proteicas capazes de interagir com ligantes. É uma técnica que aparece na literatura, para esse mapeamento. Com relação aos cálculos MM/GBSA não os realizamos com esse tipo sistema, apenas com os complexos proteína-ligante.
Abraços
Rodrigo Leandro Silveira
Entendi. Obrigado pela resposta, Mariana!