Benzazóis como potenciais sondas fluorescentes de DNA: Docking e Dinâmica Molecular

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  • Presentation type: Apresentação de Pôster / Poster Communications
  • Track: Bio- e Quimioinformatics
  • Keywords: ESIPT; Benzoxazóis; Benzimidazóis; Modelagem Molecular;

Authors:

  • 1 Universidade Federal do Rio Grande do Sul
  • 2 Departamento de Físico-Química / Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Benzazóis como potenciais sondas fluorescentes de DNA: Docking e Dinâmica Molecular

Guilherme Henkin

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Abstract

A fluorescência natural das estruturas bioquímicas no imageamento celular prejudica a análise.

O uso de sondas com elevado deslocamento de Stokes pode melhorar a relação sinal-ruído dessas técnicas.

Realizou-se um estudo de Docking em DNA, de benzazóis com elevados deslocamentos de Stokes (fluorescência via ESIPT).

Após selecionar os 5 melhores compostos, foi feita a Dinâmica Molecular desses ligantes.

Então, foram identificados 5 compostos promissores como sondas de DNA, que serão sintetizados para avaliação fotoquímica e biológica.

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Author

Guilherme Henkin

A avaliação fotoquímica dos compostos que serão feitas com o intuito de elucidar seus rendimentos quânticos e deslocamento de Stokes. Certamente estudos quânticos in silico seriam bastante interessantes, mas, devido ao custo computacional desses métodos, e com nosso enfoque na síntese dos compostos mais promissores, o estudo fotoquímico in silico terá que ficar para as próximas etapas, junto com o cálculo de energia livre. Obrigado!

Author

Guilherme Henkin

Talvez sim, pois os substituintes das sondas comerciais foram avaliados também. Porém, não apenas pelo tamanho dos substituintes dos melhores compostos, mas a interação planar do tipo pi-stacking é bastante favorável com os pares de base do DNA.