QMMM transition path sampling study of serine hydrolase mechanism

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Details
  • Presentation type: Apresentação Oral Assíncrona /Asynchronous Oral Communications
  • Track: Computational Chemistry
  • Keywords: Likelihood maximization; Reaction coordinate; Feruloyl Esterases;
  • 1 Universidade Federal do Rio de Janeiro

QMMM transition path sampling study of serine hydrolase mechanism

Rodrigo Leandro Silveira

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Abstract

Utilizamos transition path sampling para o estudo de eventos raros reativos de forma não enviesada e sem a necessidade do conhecimento a priori de uma coordenada de reação.

Após a geração de milhares de trajetórias reativas e não reativas com Transition Path Samping, utilizamos esses dados para construir, automaticamente, modelos de coordenada de reação a posteriori que melhor descrevem o ensemble de trajetórias.

O método permite o estudo de reações químicas sem a necessidade de conhecimentos a priori do mecanismo e sem a necessidade de coordenadas de reação definidas antes do conhecimento do mecanismo.

Método baseado nas ideias de Machine Learning (supervised learning).

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