Identificação de inibidores simultâneos de PARP1, Bcl-2 e Bcl-xL através de estudos computacionais

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  • Presentation type: Apresentação de Pôster / Poster Communications
  • Track: Computational Chemistry
  • Keywords: química medicinal; Docagem; terapia direcionada;

Authors:

  • 1 Universidade Federal do Rio Grande do Sul
  • 2 Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre

Identificação de inibidores simultâneos de PARP1, Bcl-2 e Bcl-xL através de estudos computacionais

Rodrigo dos Santos Fuscaldo

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Abstract

Utilizou-se a base de dados ZINC para obtenção de compostos ativos frente a PARP1, Bcl-2 e Bcl-xL.

AutoDock Vina foi utilizado para realizar a varredura dos compostos através de docking molecular.

Através do docking cruzado, selecionou-se 18 compostos com alta afinidade prevista para os 3 alvos.

3 compostos já apresentavam inibição dual da Bcl-2 e Bcl-xL, validando a metodologia.

Como perspectiva se tem a realização de dinâmica molecular e ensaios biológicos.

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Author

Rodrigo dos Santos Fuscaldo

Oi, Vinícius

A ideia do projeto foi realizar docking (que para o número de ligantes foi bem factível) e depois analisar via dinâmica molecular os compostos que tiverem bom score nos três alvos. Após a dinâmica, iremos fazer sim cálculos de energia livre utilizando o g_mmpbsa, assim teremos mais um indicador do potencial de inibição. É uma ideia legal fazer um modelo farmacofórico, ainda não exploramos esse lado, mas acredito que seja mais adequado se fôssemos procurar ligantes em espaços de busca mais amplos do que eu utilizei, utilizando o modelo farmacofórico como uma etapa anterior ao docking. É uma ideia legal!

E sim, depois de selecionar os melhores hits, a ideia é começar um novo momento do projeto, envolvendo síntese desses compostos e análogos para realizar testes biológicos. Como pegamos essas estruturas da base de dados ZINC, todos os compostos ja foram sintetizados antes, mas não aplicados para inibição multi-target.

Obrigado pelo comentário e interesse no trabalho.

Não hesite em contatar em [email protected]

Abraço,

Rodrigo