A matriz energética hodierna tem tido o foco no desenvolvimento de biocombustíveis, a exemplo do biodiesel, que substitua os derivados do petróleo. Para que o biodiesel se torne aplicável, faz-se necessário um controle de qualidade desde a matéria-prima até o produto final. Esse controle é feito por meio de métodos analíticos para certificar a qualidade do processo. Esse trabalho enfoca a definição de métodos analíticos para caracterização das matérias primas e do processo de produção do biodiesel. Neste sentido, realizou-se um estudo para identificar os métodos analíticos considerados essenciais para o controle de qualidade do biodiesel. Este trabalho propôs um comparativo entre o biodiesel produzido a partir de diferentes matérias-primas. Há parâmetros que podem ser mensurados por mais de um método, portanto, foi feito um estudo para selecionar o método mais ideal, levando em consideração o custo dos reagentes e o de maior aplicabilidade, mantendo a confiabilidade dos resultados.