O aumento da porcentagem de biodiesel na mistura com o diesel convencional resultou no aumento da produção de biodiesel e consequentemente dos efluentes gerados no processo. Visando ao enquadramento aos padrões de descarte e à produção de energia na forma de metano, que pode ser aproveitada na própria indústria produtora de biodiesel, o tratamento biológico anaeróbio foi avaliado após um tratamento físico-químico (coagulação/floculação e flotação), necessário para remoção de óleos e graxas e material coloidal. Diferentes condições de suplementação foram avaliadas na etapa biológica, sendo a suplementação com 2,8 g NH4Cl/L, 0,6 g KH2PO4/L e 1,0 mL solução de micronutrientes/L a que apresentou maior remoção de demanda química de oxigênio – DQO (98%) e produção específica de metano (268,8 mL CH4 (CNTP)/g DQO removida). Esta condição foi selecionada para a operação de reator anaeróbio de manta de lodo e fluxo ascendente (UASB).