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O Cerrado é o segundo maior bioma da América do Sul, ocupando cerca de 22% do território brasileiro e atualmente abriga cerca de 180 espécies de répteis e 150 de anfíbios. O presente estudo visa contribuir com o conhecimento sobre a composição das taxocenoses de répteis e anfíbios em um mosaico de fisionomias de cerrado na Estação Ecológica (EEc.) Santa Bárbara, no sudeste do Brasil. As amostragens foram realizadas por meio de armadilhas de interceptação e queda e procura visual. Para comparar a composição de espécies da área de estudo com outras localidades de Cerrado, nós construímos uma matriz de presença de ausência para 111 espécies de anfíbios e 121 répteis de seis taxocenoses e executamos uma análise de coordenadas principais (PCO; com índice de similaridade de Gower) e uma análise de agrupamento, utilizando método UPGMA. As localidades analisadas foram: EEc. Assis (SP), EEc. Itirapina (SP), EEc. Nova Roma (GO), Floresta Nacional de Silvânia (GO), Parque Nacional da Serra da Canastra (MG) e região do município de São João da Barra (MT). Entre maio de 2015 a abril de 2017, totalizando 120 dias de amostragem de campo, registramos 34 espécies de anfíbios entre mais de 3.000 indivíduos encontrados em campo, pertencentes a 14 gêneros em sete famílias. Entre os répteis foram encontradas 38 espécies entre mais de 800 indivíduos, pertencentes a 27 gêneros de 12 famílias. Como esperado, a área de estudo apresentou maior similaridade com as localidades de cerrado mais próximas (Assis e Itirapina), sendo Assis mais similar quanto à composição de anfíbios e Itirapina quanto à composição de lagartos e serpentes. Os resultados obtidos até o momento indicam que a EEc. Santa Bárbara tem um papel importante para a conservação de uma herpetofauna diversa sendo representativa da porção meridional do Cerrado.
Palavras-chave: Comunidade, répteis, anfíbios,Cerrado.