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Os lagartos neotropicais do complexo Loxopholis percarinatum são intrigantes por apresentarem reprodução unissexual/bissexual e incluir espécies com diferentes níveis de ploidia (2n e 3n). Alguns paradigmas sobre a origem e os impactos da reprodução independente do sexo vêm sendo derrubados nos últimos tempos. Os mecanismos por trás da origem da partenogênese em L. percarinatum foram esclarecidos recentemente. Além de descobrirmos que a origem da partenogênese em Loxopholis é mais antiga do que os demais casos descritos na literatura, curiosamente, também detectamos sinais de hibridização recente entre fêmeas partenogenéticas e machos da espécie ancestral materna em uma região localizada no oeste do rio Negro. Estes resultados trouxeram alguns desafios relacionados com a detecção do nível de ploidia e com a estimativa da variabilidade genética dos indivíduos. Para resolver estas questões, utilizamos dados de Sequenciamento de Nova-geração, especificamente, milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP’s) detectados através do método de ddRAD-seq.
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