O manejo do solo e de culturas afetam diretamente o habitat de micro-organismos, que são considerados componentes críticos dos ecossistemas naturais ou antropizados, por regularem a decomposição do material orgânico, os ciclos biogeoquímicos, com efeito direto na fertilidade e na estrutura do solo. Neste sentido, parâmetros microbiológicos têm sido utilizados com sucesso como bioindicadores de qualidade do solo, por serem rápidos e sensíveis aos efeitos provocados pelo uso e manejo. O objetivo do trabalho foi avaliar os parâmetros matéria orgânica (MO), nitrogênio da biomassa microbiana (NBM), bem como a respiração basal (RB) em solo com as culturas de café e milho e com pastagem, tomando como referencial solo de mata nativa. O experimento foi realizado na Fazenda Escola da Universidade Estadual de Londrina em um LATOSSOLO VERMELHO eutroférrico. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com parcelas subdivididas com cinco repetições. Avaliou-se a MO, o NBM pelo método de fumigação-extração e a RB. Os resultados obtidos foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey (p<0,05). Os valores de MO e NBM na pastagem e no cultivo de café não diferiram estatisticamente, do solo da mata nativa. Menores valores de RB também foram encontrados nesses sistemas. A área de pastagem, ausente de manejo desde sua introdução, a mais de 25 anos, acumulou alto conteúdo de material orgânico que somada a densa massa radicular das gramíneas estimulou a atividade microbiana. O mesmo comportamento foi observado na área com café, uma vez, que está se encontrava sem manejo a mais de 5 anos. Os atributos biológicos do solo são influenciados por fatores como temperatura e umidade, desse modo, sistemas com maior revolvimento do solo promovem modificações nesses atributos. Nesse trabalho, a baixa taxa de RB no pasto, café e mata nativa pode ser interpretada como um sinal de equilíbrio biológico do sistema. No solo proveniente do cultivo do milho, foram observados menores valores de MO e NBM, enquanto a RB teve maior valor. Os resultados demonstram que culturas com intenso revolvimento do solo, expõem a MO dos agregados, o que facilita sua oxidação e a mineralização do nitrogênio, podendo limitar o desenvolvimento e rendimento das culturas.