A observação e a experimentação são indicadas pelos PCN como estratégias didáticas que auxiliam na obtenção de informação. As possibilidades de aprendizagem proporcionadas pelas atividades práticas dependem de como estas são propostas e desenvolvidas com os alunos. Estas atividades práticas são classificadas como: experimentos demonstrativos, ilustrativos, descritivos e investigativos ou laboratório aberto. A prática investigativa é um tipo de atividade que favorece o processo de ensino-aprendizagem, pois permite explorar outros conceitos envolvidos no fenômeno e permite que o aluno relacione o conteúdo com o seu cotidiano. A Microbiologia é uma ciência repleta de contradições, capazes de estimular o pensamento crítico e científico dos alunos, alem de ser uma das áreas da Biologia com maior caráter social e mais envolvida com o cotidiano da população. Nesse contexto, esse trabalho tem como objetivo testar a hipótese de utilização de modalidade de aulas práticas com o pressuposto que estas levam o aluno a desenvolver e despertar seu senso critico através de dois métodos: prática ilustrativa e prática investigativa aliada ao tema gerador de microbiologia, onde será testado o conhecimento do aluno com a influência do professor para o ensino da ciência. Avaliar a pertinência dos resultados e a aceitação dos processos propostos, aplicar formas alternativas para o ensino de ciências e apresentar mapas conceituais como método de avaliação de aprendizagem significativa. A aplicação do presente estudo se deu através de 4 intervenções sendo respectivamente; Intervenção 1: Ensino de mapa conceitual, Intervenção 2: Prática investigativa - desenvolvimento da prática, Intervenção 3: Prática investigativa – análise dos resultados e construção do mapa conceitual, Intervenção 4: Prática Ilustrativa- desenvolvimento da prática. Os resultados obtidos até o presente momento estão sendo analisados através dos mapas conceituais construídos pelos alunos após a atividade investigativa e após a pratica ilustrativa. Sendo os mapas analisados seguindo os critérios de: Conceitos, Inter-relações entre conceitos e Estrutura do mapa. A prática visa inserir o aluno através de suas concepções cognitivas, ampliando tais conhecimento frente a um novo aprender, além de proporcionar um resultado (positivo ou negativo) para propostas de atividades inovadoras de ensino e aprendizagem.